NextComp Project

Molecular Dynamics on a Computational Grid Environment

This project aims the simulation of the molecular dynamics based on the non-extensive statistics and the generalized mechanics using a computational distributed environment (Grid). We are developing and testing the programs using CHARM++ language. Charm++ is a machine independent parallel programming system that simplifies parallel job submission and monitoring, and efficiently exploits grid-based resources.
   
Using Charm++ in the CBPF Cluster
  Instalando o Charm++ no Cluster do CBPF
 
Available Source Codes
  nextcomp-0.2.tgz Nova versão do programa com alterações de estilo de codificação.
  nextcomp-0.1.tgz

Instalação do NextComp-0.1 no Cluster do CBPF

Compilação dos Código originais e em Charm++
Exemplo de Execução
 
  third_charm_hello_world.zip Hello World using reduction features ...
  second_charm_hello_world.zip Hello World using 1D array features ...
  first_charm_hello_world.zip A simple Charm++ program - Hello World in Charm
  modular.zip Original program for integration of the trajectories of a group of rotators: Numerical simulation of a system of coupled rotators.
  integral.tar Programa de Integração Numérica usando MPI
   
Available Documents
  charm++.pdf The Charm++ Programming Language Manual
  cursompi.pdf Curso de MPI - CENAPAD - NE
  Introducao-Programacao-Paralela-E-Cluster-P1.pdf Introdução a Programação Paralela e Cluster
  Introducao-Programacao-Paralela-E-Cluster-threads-P2.pdf Introdução Programação Paralela e Cluster - Threads
RNP Giga Project

The NextComp Project is part of the “INTEGRIDADE - Middleware Development for Computational Grids over the Brazilian Research Giga-Network”, one of the RNP GIGA Project – in collaboration with LNCC; UFF; UFRGS; UNICAMP; NCSA/UIUC; PUC-Rio and UFES.

Partners
  CBPF - Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas

 
  TEO - Coordenação de Física Teórica - Grupo de Física Estatística
CAT - Coordenação de Atividades Técnicas
Santa Fé Institute
University College London

 
  CCS - Centre for Computational Science
Università di Padova

 
  Dipartimento di Fisica
Laboratório Nacional de Computação Científica

 
  CCC - Coordenação de Ciência da Computação
Useful Links
CBPF Grid Project
Charm++
August, 2005